Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms