Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNB1P98172 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms