Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms