Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms