Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAP25P60880 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms