Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms