Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB25P57735 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB25P57735 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms