Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCBP4P57723 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCBP4P57723 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms