Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms