Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LUMP51884 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms