Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC3P51654 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC3P51654 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC3P51654 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC3P51654 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC3P51654 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC3P51654 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms