Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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