Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTAP49354 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTAP49354 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTAP49354 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms