Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms