Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms