Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA4P43681 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms