Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA1P42261 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA1P42261 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms