Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms