Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms