Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG3P32926 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG3P32926 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG3P32926 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG3P32926 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG3P32926 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSG3P32926 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSG3P32926 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG3P32926 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms