Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms