Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms