Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms