Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGS1P23219 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGS1P23219 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGS1P23219 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGS1P23219 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGS1P23219 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGS1P23219 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGS1P23219 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGS1P23219 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGS1P23219 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms