Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms