Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR1P18146 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms