Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms