Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB1P14653 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms