Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRF1P14222 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRF1P14222 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRF1P14222 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms