Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNT1P13805 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms