Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC166P0CW27 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms