Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms