Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSLP07711 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSLP07711 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSLP07711 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSLP07711 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms