Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF2P04141 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF2P04141 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms