Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms