Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8AP01732 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8AP01732 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8AP01732 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8AP01732 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms