Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX6O95503 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX6O95503 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms