Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms