Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3O43889 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms