Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXO3O43524 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms