Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms