Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms