Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
O00370 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
O00370 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
O00370 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
O00370 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms