Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPBD1B2RD01 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms