Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms