Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms