Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8AA7E2F4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms