Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms