Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms