Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF316A6NFI3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms